田園洞遺址外觀圖受訪者供圖
零落成泥碾作塵，只有香如故。
數(shù)萬年前古人類的基因組也可以從化石中提取出來，也可以測序?
國際上最新的古DNA技術(shù)，讓數(shù)萬年甚至幾十萬年前古人類的DNA從人類化石甚至土壤中獲得，成為一種可能。
北京房山的田園洞曾出土一具四萬年前男性的骨骼化石。中國科學(xué)院古脊椎動物與古人類研究所的研究人員從其富含細(xì)菌和真菌DNA污染的化石樣品中，通過他們和德國合作團隊一同開發(fā)的一種特殊的捕獲技術(shù)，將混雜在大量微生物DNA中極其微量的古人類的DNA篩選出來，并進行了測序。
由此，中國地區(qū)古人類的第一個基因組、整個東亞地區(qū)最古老的人類基因組誕生。
科學(xué)家們對這一難得的基因組數(shù)據(jù)進行了充分研究，他們將其與世界范圍內(nèi)各種人群的基因組數(shù)據(jù)等進行了比對。研究最終證實，田園洞人屬于古東亞人，但他并非現(xiàn)代東亞人的直接祖先。也就是說，田園洞人這一支系的東亞人沒能繁衍至今。
科學(xué)家驚訝地發(fā)現(xiàn)，四萬年前，雖然田園洞人居住在中國北京房山地區(qū)，他們卻跟來自比利時的古歐洲人有遺傳聯(lián)系。但這并不意味著北京田園洞人擁有歐洲血統(tǒng)。此外，研究人員發(fā)現(xiàn)，在美洲土著的各個人群中，美洲的亞馬遜人與北京田園洞人的遺傳關(guān)系最近。
10月13日，該論文在線發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊《現(xiàn)代生物學(xué)》(Current Biology)上，標(biāo)題為題為“四萬年前亞洲人為歐亞早期人群結(jié)構(gòu)提供新洞見”(40,000-Year-Old Individual from Asia Provides Insight into Early Population Structure in Eurasia)。
該研究項目由中國科學(xué)院古脊椎動物與古人類研究所研究員付巧妹、Melinda Yang、高星、同號文與德國馬普進化人類研究所等團隊合作完成。
神奇技術(shù)可釣取零落在化石中數(shù)萬年前古人類的DNA
在德國進行研究時，付巧妹與合作者開發(fā)了從樣品中“釣取”古人類基因組的技術(shù)方法，該論文2013年發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊《美國科學(xué)院院刊》(PNAS)上。
12日晚，參與該研究的中科院古脊椎動物與古人類研究所研究員付巧妹告訴澎湃新聞(www.thepaper.cn)，受到該方法的啟示，全球更多研究人員開始嘗試釣取，并拼接出不同年代、不同地區(qū)的古人類基因組。僅從2015年到2017年下半年，已經(jīng)有超過6篇關(guān)于古人類基因組研究的論文發(fā)表在國際頂級學(xué)術(shù)期刊上，如自然雜志。
在這個神奇的技術(shù)中，他們要合成一系列特殊的DNA探針，當(dāng)作魚鉤，在泥土、化石等樣品中釣想要的古人類DNA。
用這樣的方法，2013年，付巧妹拼接出古人類田園洞人的第21號染色體?，F(xiàn)在，她又釣取并拼接出另外幾十條染色體，得到第一個來自中國的古人類的整個基因組。
但付巧妹向澎湃新聞強調(diào)，這個釣取并拼接成的基因組，并非完整的基因組。它還缺失了很多基因片段。但這個田園洞人基因組測序數(shù)據(jù)涵蓋了整個基因組上研究人員最感興趣的群體遺傳學(xué)基因的位點。所以，更準(zhǔn)確地說，這是全基因組水平上的測序數(shù)據(jù)。
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